Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms