Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rag1P15919 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rag1P15919 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rag1P15919 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rag1P15919 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rag1P15919 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rag1P15919 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rag1P15919 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rag1P15919 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rag1P15919 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms