Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRFP10586 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRFP10586 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRFP10586 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRFP10586 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRFP10586 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PTPRFP10586 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRFP10586 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRFP10586 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PTPRFP10586 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRFP10586 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRFP10586 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRFP10586 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRFP10586 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRFP10586 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRFP10586 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRFP10586 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRFP10586 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRFP10586 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRFP10586 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRFP10586 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRFP10586 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRFP10586 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRFP10586 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRFP10586 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRFP10586 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRFP10586 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRFP10586 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRFP10586 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRFP10586 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTPRFP10586 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTPRFP10586 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRFP10586 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTPRFP10586 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRFP10586 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTPRFP10586 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRFP10586 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRFP10586 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRFP10586 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRFP10586 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRFP10586 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRFP10586 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRFP10586 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRFP10586 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRFP10586 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRFP10586 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRFP10586 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRFP10586 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTPRFP10586 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRFP10586 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRFP10586 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRFP10586 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTPRFP10586 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRFP10586 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRFP10586 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRFP10586 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRFP10586 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRFP10586 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRFP10586 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRFP10586 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRFP10586 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRFP10586 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRFP10586 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRFP10586 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRFP10586 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRFP10586 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRFP10586 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRFP10586 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRFP10586 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRFP10586 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRFP10586 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRFP10586 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRFP10586 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTPRFP10586 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms