Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa9P09631 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms