Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtaP09225 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtaP09225 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtaP09225 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtaP09225 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtaP09225 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtaP09225 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtaP09225 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtaP09225 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtaP09225 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtaP09225 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtaP09225 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtaP09225 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtaP09225 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtaP09225 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtaP09225 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtaP09225 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtaP09225 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
LtaP09225 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtaP09225 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtaP09225 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtaP09225 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtaP09225 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtaP09225 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtaP09225 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
LtaP09225 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtaP09225 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtaP09225 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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LtaP09225 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtaP09225 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtaP09225 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtaP09225 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtaP09225 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtaP09225 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtaP09225 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtaP09225 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtaP09225 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtaP09225 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtaP09225 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtaP09225 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtaP09225 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtaP09225 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.35
LtaP09225 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
LtaP09225 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
LtaP09225 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
LtaP09225 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
LtaP09225 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LtaP09225 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LtaP09225 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LtaP09225 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LtaP09225 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LtaP09225 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LtaP09225 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LtaP09225 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
LtaP09225 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LtaP09225 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LtaP09225 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LtaP09225 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
LtaP09225 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
LtaP09225 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
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LtaP09225 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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LtaP09225 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
LtaP09225 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
LtaP09225 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LtaP09225 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LtaP09225 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LtaP09225 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
LtaP09225 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LtaP09225 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
LtaP09225 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LtaP09225 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LtaP09225 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LtaP09225 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LtaP09225 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LtaP09225 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LtaP09225 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LtaP09225 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
LtaP09225 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LtaP09225 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LtaP09225 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LtaP09225 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LtaP09225 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LtaP09225 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LtaP09225 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LtaP09225 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LtaP09225 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LtaP09225 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LtaP09225 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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