Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms