Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG12O94817 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG12O94817 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG12O94817 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG12O94817 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG12O94817 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG12O94817 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG12O94817 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG12O94817 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG12O94817 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG12O94817 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG12O94817 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG12O94817 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG12O94817 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG12O94817 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG12O94817 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG12O94817 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG12O94817 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG12O94817 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG12O94817 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG12O94817 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG12O94817 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG12O94817 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG12O94817 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG12O94817 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG12O94817 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG12O94817 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG12O94817 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG12O94817 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG12O94817 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG12O94817 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG12O94817 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG12O94817 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG12O94817 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG12O94817 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG12O94817 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG12O94817 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG12O94817 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG12O94817 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG12O94817 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG12O94817 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG12O94817 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG12O94817 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG12O94817 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG12O94817 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG12O94817 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG12O94817 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG12O94817 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG12O94817 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG12O94817 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG12O94817 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG12O94817 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG12O94817 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG12O94817 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG12O94817 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG12O94817 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG12O94817 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG12O94817 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG12O94817 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG12O94817 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG12O94817 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG12O94817 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG12O94817 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG12O94817 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG12O94817 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG12O94817 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG12O94817 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG12O94817 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG12O94817 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG12O94817 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG12O94817 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG12O94817 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG12O94817 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG12O94817 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG12O94817 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG12O94817 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG12O94817 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG12O94817 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG12O94817 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG12O94817 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG12O94817 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG12O94817 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG12O94817 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG12O94817 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG12O94817 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG12O94817 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG12O94817 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG12O94817 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG12O94817 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG12O94817 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG12O94817 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG12O94817 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG12O94817 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG12O94817 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG12O94817 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG12O94817 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG12O94817 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG12O94817 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG12O94817 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG12O94817 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms