Protein–RNA interactions for Protein: O88533

Ddc, Aromatic-L-amino-acid decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DdcO88533 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DdcO88533 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DdcO88533 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DdcO88533 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DdcO88533 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DdcO88533 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DdcO88533 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DdcO88533 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DdcO88533 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DdcO88533 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DdcO88533 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DdcO88533 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DdcO88533 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DdcO88533 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DdcO88533 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DdcO88533 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DdcO88533 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DdcO88533 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DdcO88533 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DdcO88533 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DdcO88533 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DdcO88533 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DdcO88533 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DdcO88533 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DdcO88533 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DdcO88533 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DdcO88533 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DdcO88533 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DdcO88533 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DdcO88533 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DdcO88533 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DdcO88533 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DdcO88533 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DdcO88533 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DdcO88533 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DdcO88533 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DdcO88533 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DdcO88533 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DdcO88533 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DdcO88533 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DdcO88533 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DdcO88533 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DdcO88533 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DdcO88533 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DdcO88533 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DdcO88533 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DdcO88533 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DdcO88533 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DdcO88533 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DdcO88533 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DdcO88533 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DdcO88533 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DdcO88533 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DdcO88533 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DdcO88533 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DdcO88533 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DdcO88533 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DdcO88533 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DdcO88533 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DdcO88533 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DdcO88533 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DdcO88533 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DdcO88533 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DdcO88533 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DdcO88533 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DdcO88533 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DdcO88533 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DdcO88533 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DdcO88533 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DdcO88533 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DdcO88533 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DdcO88533 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DdcO88533 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DdcO88533 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DdcO88533 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DdcO88533 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DdcO88533 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DdcO88533 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DdcO88533 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DdcO88533 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DdcO88533 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DdcO88533 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DdcO88533 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DdcO88533 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DdcO88533 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DdcO88533 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DdcO88533 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DdcO88533 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DdcO88533 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DdcO88533 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DdcO88533 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DdcO88533 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DdcO88533 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DdcO88533 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DdcO88533 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DdcO88533 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DdcO88533 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DdcO88533 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DdcO88533 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DdcO88533 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms