Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Csnk2a2O54833 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a2O54833 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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