Protein–RNA interactions for Protein: O35929

Rem1, GTP-binding protein REM 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rem1O35929 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rem1O35929 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rem1O35929 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rem1O35929 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rem1O35929 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rem1O35929 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rem1O35929 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rem1O35929 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rem1O35929 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rem1O35929 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rem1O35929 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rem1O35929 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Rem1O35929 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rem1O35929 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Rem1O35929 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rem1O35929 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rem1O35929 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rem1O35929 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rem1O35929 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rem1O35929 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rem1O35929 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rem1O35929 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rem1O35929 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rem1O35929 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rem1O35929 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rem1O35929 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rem1O35929 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rem1O35929 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rem1O35929 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rem1O35929 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rem1O35929 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rem1O35929 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rem1O35929 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rem1O35929 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rem1O35929 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rem1O35929 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rem1O35929 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rem1O35929 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rem1O35929 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rem1O35929 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rem1O35929 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rem1O35929 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rem1O35929 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rem1O35929 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rem1O35929 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rem1O35929 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rem1O35929 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rem1O35929 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rem1O35929 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rem1O35929 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rem1O35929 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rem1O35929 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rem1O35929 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rem1O35929 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rem1O35929 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rem1O35929 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rem1O35929 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rem1O35929 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rem1O35929 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rem1O35929 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rem1O35929 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rem1O35929 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rem1O35929 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rem1O35929 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rem1O35929 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rem1O35929 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rem1O35929 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rem1O35929 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rem1O35929 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rem1O35929 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rem1O35929 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rem1O35929 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rem1O35929 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rem1O35929 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rem1O35929 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rem1O35929 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rem1O35929 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rem1O35929 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rem1O35929 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rem1O35929 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rem1O35929 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rem1O35929 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rem1O35929 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rem1O35929 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rem1O35929 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rem1O35929 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rem1O35929 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rem1O35929 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rem1O35929 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rem1O35929 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rem1O35929 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rem1O35929 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rem1O35929 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rem1O35929 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rem1O35929 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rem1O35929 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rem1O35929 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rem1O35929 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rem1O35929 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rem1O35929 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms