Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Edil3O35474 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edil3O35474 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edil3O35474 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Edil3O35474 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Edil3O35474 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Edil3O35474 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Edil3O35474 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms