Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps1O08983 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps1O08983 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps1O08983 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps1O08983 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps1O08983 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hps1O08983 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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