Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms