Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8005F6YKY3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8005F6YKY3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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