Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8247F6VRJ8 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8247F6VRJ8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms