Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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