Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8F9

6030445D17Rik, RIKEN cDNA 6030445D17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030445D17RikE9Q8F9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
6030445D17RikE9Q8F9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms