Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Myo5cE9Q1F5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Myo5cE9Q1F5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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