Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms