Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms