Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trappc8E9PWG2 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms