Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kpna7C0LLJ0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kpna7C0LLJ0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms