Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyp26c1B2RXA7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cyp26c1B2RXA7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cyp26c1B2RXA7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cyp26c1B2RXA7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cyp26c1B2RXA7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cyp26c1B2RXA7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cyp26c1B2RXA7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cyp26c1B2RXA7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cyp26c1B2RXA7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cyp26c1B2RXA7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cyp26c1B2RXA7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cyp26c1B2RXA7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cyp26c1B2RXA7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cyp26c1B2RXA7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cyp26c1B2RXA7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cyp26c1B2RXA7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cyp26c1B2RXA7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cyp26c1B2RXA7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cyp26c1B2RXA7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cyp26c1B2RXA7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cyp26c1B2RXA7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cyp26c1B2RXA7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cyp26c1B2RXA7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cyp26c1B2RXA7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cyp26c1B2RXA7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cyp26c1B2RXA7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cyp26c1B2RXA7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cyp26c1B2RXA7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms