Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cfap58B2RW38 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms