Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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