Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9E8

Ttll6, Tubulin polyglutamylase TTLL6, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll6A4Q9E8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttll6A4Q9E8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms