Protein–RNA interactions for Protein: A2ABU4

Myom3, Myomesin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myom3A2ABU4 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myom3A2ABU4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms