Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prdm16A2A935 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms