Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms