Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSI2

1700018G05Rik, RIKEN cDNA 1700018G05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms