Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C6

Upk1b, Uroplakin-1b, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1bQ9Z2C6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Upk1bQ9Z2C6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Upk1bQ9Z2C6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Upk1bQ9Z2C6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Upk1bQ9Z2C6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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