Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms