Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnnt3Q9QZ47 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnt3Q9QZ47 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnt3Q9QZ47 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnt3Q9QZ47 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnt3Q9QZ47 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnt3Q9QZ47 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnt3Q9QZ47 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnt3Q9QZ47 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnt3Q9QZ47 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnt3Q9QZ47 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnt3Q9QZ47 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnt3Q9QZ47 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnt3Q9QZ47 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnt3Q9QZ47 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnt3Q9QZ47 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnt3Q9QZ47 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnt3Q9QZ47 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnt3Q9QZ47 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnt3Q9QZ47 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnnt3Q9QZ47 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnnt3Q9QZ47 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnnt3Q9QZ47 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnnt3Q9QZ47 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnnt3Q9QZ47 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnnt3Q9QZ47 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnnt3Q9QZ47 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnnt3Q9QZ47 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnnt3Q9QZ47 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnnt3Q9QZ47 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnnt3Q9QZ47 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnnt3Q9QZ47 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnnt3Q9QZ47 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms