Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Irx4Q9QY61 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx4Q9QY61 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms