Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWH1

Phc2, Polyhomeotic-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 850 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc2Q9QWH1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms