Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tcea2Q9QVN7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tcea2Q9QVN7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tcea2Q9QVN7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tcea2Q9QVN7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tcea2Q9QVN7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tcea2Q9QVN7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tcea2Q9QVN7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tcea2Q9QVN7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tcea2Q9QVN7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tcea2Q9QVN7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tcea2Q9QVN7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tcea2Q9QVN7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tcea2Q9QVN7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Tcea2Q9QVN7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tcea2Q9QVN7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tcea2Q9QVN7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tcea2Q9QVN7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tcea2Q9QVN7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tcea2Q9QVN7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tcea2Q9QVN7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tcea2Q9QVN7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tcea2Q9QVN7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tcea2Q9QVN7 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tcea2Q9QVN7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tcea2Q9QVN7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tcea2Q9QVN7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tcea2Q9QVN7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tcea2Q9QVN7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tcea2Q9QVN7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tcea2Q9QVN7 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tcea2Q9QVN7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tcea2Q9QVN7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tcea2Q9QVN7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tcea2Q9QVN7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tcea2Q9QVN7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tcea2Q9QVN7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tcea2Q9QVN7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tcea2Q9QVN7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tcea2Q9QVN7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tcea2Q9QVN7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms