Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms