Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Tuba8Q9JJZ2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tuba8Q9JJZ2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tuba8Q9JJZ2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tuba8Q9JJZ2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tuba8Q9JJZ2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tuba8Q9JJZ2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tuba8Q9JJZ2 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tuba8Q9JJZ2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tuba8Q9JJZ2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Tuba8Q9JJZ2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Tuba8Q9JJZ2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tuba8Q9JJZ2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tuba8Q9JJZ2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tuba8Q9JJZ2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tuba8Q9JJZ2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tuba8Q9JJZ2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tuba8Q9JJZ2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tuba8Q9JJZ2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tuba8Q9JJZ2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tuba8Q9JJZ2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tuba8Q9JJZ2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tuba8Q9JJZ2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tuba8Q9JJZ2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tuba8Q9JJZ2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tuba8Q9JJZ2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tuba8Q9JJZ2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tuba8Q9JJZ2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tuba8Q9JJZ2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tuba8Q9JJZ2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tuba8Q9JJZ2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tuba8Q9JJZ2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tuba8Q9JJZ2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tuba8Q9JJZ2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tuba8Q9JJZ2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tuba8Q9JJZ2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tuba8Q9JJZ2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tuba8Q9JJZ2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tuba8Q9JJZ2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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