Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad9Q9JIW5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms