Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms