Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms