Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms