Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfcp2Q9ERA0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Tfcp2Q9ERA0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tfcp2Q9ERA0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tfcp2Q9ERA0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tfcp2Q9ERA0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tfcp2Q9ERA0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfcp2Q9ERA0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfcp2Q9ERA0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfcp2Q9ERA0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfcp2Q9ERA0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfcp2Q9ERA0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfcp2Q9ERA0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfcp2Q9ERA0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfcp2Q9ERA0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfcp2Q9ERA0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfcp2Q9ERA0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfcp2Q9ERA0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfcp2Q9ERA0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfcp2Q9ERA0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfcp2Q9ERA0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfcp2Q9ERA0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfcp2Q9ERA0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfcp2Q9ERA0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfcp2Q9ERA0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tfcp2Q9ERA0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tfcp2Q9ERA0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tfcp2Q9ERA0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tfcp2Q9ERA0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tfcp2Q9ERA0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tfcp2Q9ERA0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tfcp2Q9ERA0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tfcp2Q9ERA0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tfcp2Q9ERA0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tfcp2Q9ERA0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tfcp2Q9ERA0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms