Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms