Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clstn1Q9EPL2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms