Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms