Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Hmg20aQ9DC33 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Hmg20aQ9DC33 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Hmg20aQ9DC33 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Hmg20aQ9DC33 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Hmg20aQ9DC33 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Hmg20aQ9DC33 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Hmg20aQ9DC33 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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Hmg20aQ9DC33 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Hmg20aQ9DC33 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Hmg20aQ9DC33 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hmg20aQ9DC33 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hmg20aQ9DC33 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hmg20aQ9DC33 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hmg20aQ9DC33 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hmg20aQ9DC33 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hmg20aQ9DC33 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hmg20aQ9DC33 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hmg20aQ9DC33 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hmg20aQ9DC33 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hmg20aQ9DC33 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hmg20aQ9DC33 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hmg20aQ9DC33 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hmg20aQ9DC33 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hmg20aQ9DC33 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hmg20aQ9DC33 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hmg20aQ9DC33 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Hmg20aQ9DC33 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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