Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9DA42 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9DA42 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9DA42 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9DA42 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9DA42 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9DA42 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9DA42 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9DA42 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9DA42 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9DA42 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9DA42 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9DA42 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9DA42 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9DA42 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9DA42 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9DA42 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9DA42 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9DA42 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9DA42 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9DA42 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9DA42 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9DA42 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9DA42 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9DA42 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9DA42 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9DA42 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9DA42 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9DA42 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9DA42 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9DA42 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9DA42 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9DA42 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9DA42 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9DA42 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9DA42 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9DA42 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9DA42 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9DA42 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9DA42 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9DA42 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9DA42 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9DA42 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9DA42 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9DA42 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9DA42 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9DA42 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9DA42 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9DA42 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9DA42 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9DA42 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9DA42 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9DA42 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9DA42 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9DA42 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9DA42 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9DA42 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9DA42 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9DA42 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9DA42 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9DA42 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9DA42 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9DA42 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9DA42 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9DA42 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9DA42 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9DA42 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9DA42 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9DA42 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9DA42 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9DA42 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9DA42 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9DA42 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9DA42 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9DA42 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9DA42 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9DA42 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9DA42 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9DA42 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9DA42 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9DA42 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9DA42 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DA42 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DA42 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DA42 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DA42 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DA42 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DA42 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DA42 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DA42 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DA42 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DA42 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DA42 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DA42 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DA42 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DA42 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DA42 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DA42 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DA42 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DA42 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms