Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Derl3Q9D8K3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Derl3Q9D8K3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms