Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf13Q9D777 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfsf13Q9D777 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfsf13Q9D777 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfsf13Q9D777 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfsf13Q9D777 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfsf13Q9D777 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfsf13Q9D777 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfsf13Q9D777 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfsf13Q9D777 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfsf13Q9D777 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfsf13Q9D777 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfsf13Q9D777 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf13Q9D777 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf13Q9D777 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf13Q9D777 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf13Q9D777 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf13Q9D777 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf13Q9D777 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf13Q9D777 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf13Q9D777 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf13Q9D777 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf13Q9D777 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf13Q9D777 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf13Q9D777 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf13Q9D777 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf13Q9D777 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf13Q9D777 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf13Q9D777 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf13Q9D777 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf13Q9D777 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf13Q9D777 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf13Q9D777 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf13Q9D777 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf13Q9D777 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf13Q9D777 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf13Q9D777 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf13Q9D777 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf13Q9D777 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfsf13Q9D777 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfsf13Q9D777 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfsf13Q9D777 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfsf13Q9D777 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfsf13Q9D777 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfsf13Q9D777 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tnfsf13Q9D777 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfsf13Q9D777 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfsf13Q9D777 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfsf13Q9D777 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfsf13Q9D777 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfsf13Q9D777 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfsf13Q9D777 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms